Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms