Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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