Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B4DEV8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B4DEV8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B4DEV8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B4DEV8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B4DEV8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms