Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB5A8MRT5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB5A8MRT5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms