Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRIQ3A6PVS8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms