Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPDYE4A6NLX3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDYE4A6NLX3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms