Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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