Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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