Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A3GALT2U3KPV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A3GALT2U3KPV4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A3GALT2U3KPV4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A3GALT2U3KPV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A3GALT2U3KPV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A3GALT2U3KPV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms