Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NCOA3Q9Y6Q9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NCOA3Q9Y6Q9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NCOA3Q9Y6Q9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA3Q9Y6Q9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA3Q9Y6Q9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
NCOA3Q9Y6Q9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NCOA3Q9Y6Q9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NCOA3Q9Y6Q9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCOA3Q9Y6Q9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA3Q9Y6Q9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCOA3Q9Y6Q9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCOA3Q9Y6Q9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NCOA3Q9Y6Q9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NCOA3Q9Y6Q9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCOA3Q9Y6Q9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NCOA3Q9Y6Q9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms