Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJA3Q9Y6H8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GJA3Q9Y6H8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GJA3Q9Y6H8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GJA3Q9Y6H8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GJA3Q9Y6H8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GJA3Q9Y6H8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJA3Q9Y6H8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GJA3Q9Y6H8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GJA3Q9Y6H8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GJA3Q9Y6H8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GJA3Q9Y6H8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJA3Q9Y6H8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJA3Q9Y6H8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms