Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms