Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRT4Q9Y6E7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRT4Q9Y6E7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT4Q9Y6E7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRT4Q9Y6E7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRT4Q9Y6E7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms