Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUBP2Q9Y5Y2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUBP2Q9Y5Y2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUBP2Q9Y5Y2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUBP2Q9Y5Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms