Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX8Q9Y5X2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX8Q9Y5X2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX8Q9Y5X2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX8Q9Y5X2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX8Q9Y5X2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms