Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB4Q9Y5E5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB4Q9Y5E5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB4Q9Y5E5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB4Q9Y5E5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB4Q9Y5E5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCDHB4Q9Y5E5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB4Q9Y5E5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB4Q9Y5E5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB4Q9Y5E5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms