Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAXBP1Q9Y5B6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PAXBP1Q9Y5B6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PAXBP1Q9Y5B6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXBP1Q9Y5B6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms