Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR3HQ9Y535 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3HQ9Y535 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR3HQ9Y535 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3HQ9Y535 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms