Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB1Q9Y478 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB1Q9Y478 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB1Q9Y478 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB1Q9Y478 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKAB1Q9Y478 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB1Q9Y478 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms