Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
R3HCC1Q9Y3T6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
R3HCC1Q9Y3T6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
R3HCC1Q9Y3T6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
R3HCC1Q9Y3T6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
R3HCC1Q9Y3T6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms