Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIT1Q9Y3P8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIT1Q9Y3P8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIT1Q9Y3P8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIT1Q9Y3P8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIT1Q9Y3P8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIT1Q9Y3P8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIT1Q9Y3P8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms