Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3I1

FBXO7, F-box only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO7Q9Y3I1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO7Q9Y3I1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO7Q9Y3I1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO7Q9Y3I1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO7Q9Y3I1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO7Q9Y3I1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms