Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T4

PPP2R2C, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2CQ9Y2T4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP2R2CQ9Y2T4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP2R2CQ9Y2T4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP2R2CQ9Y2T4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP2R2CQ9Y2T4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP2R2CQ9Y2T4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP2R2CQ9Y2T4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms