Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 512.68□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 512.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 212.58□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 24.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-212ENST00000497001 1488 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.936e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-209ENST00000485044 1944 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-211ENST00000493535 1626 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-208ENST00000468525 2727 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-213ENST00000612032 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-203ENST00000411578 4683 ntTSL 512.76□□□□□ -0.376e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 36.9
DDX52Q9Y2R4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.12e-10■■■■■ 36.6
DDX52Q9Y2R4 FGD5-AS1-201ENST00000417835 1630 ntTSL 1 (best)27.85■■■□□ 2.052e-10■■■■■ 36.6
DDX52Q9Y2R4 FGD5-AS1-203ENST00000426200 1874 ntTSL 1 (best)25.42■■□□□ 1.662e-10■■■■■ 36.6
DDX52Q9Y2R4 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)22.77■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 36.4
DDX52Q9Y2R4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 36.4
DDX52Q9Y2R4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.358e-35■■■■■ 36.4
DDX52Q9Y2R4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.028e-35■■■■■ 36.4
DDX52Q9Y2R4 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.92□□□□□ -0.188e-35■■■■■ 36.4
DDX52Q9Y2R4 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 423.19■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 36.1
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 527.67■■■□□ 2.024e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.924e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 526.2■■□□□ 1.784e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 326.2■■□□□ 1.784e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 226.03■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 425.98■■□□□ 1.754e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 322.91■■□□□ 1.264e-6■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 318.99■□□□□ 0.634e-58■■■■■ 35.7
DDX52Q9Y2R4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.434e-6■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 TMCO3-204ENST00000462877 491 ntTSL 29.53□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-58■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.465e-58■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.625e-58■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.095e-58■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.795e-58■■■■■ 35.4
DDX52Q9Y2R4 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 419.38■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 35
DDX52Q9Y2R4 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 34.6
DDX52Q9Y2R4 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 34.5
DDX52Q9Y2R4 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 34.5
DDX52Q9Y2R4 PPARGC1B-206ENST00000461780 566 ntTSL 418.09■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 34.5
DDX52Q9Y2R4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 34.5
DDX52Q9Y2R4 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -05e-6■■■■■ 34.5
DDX52Q9Y2R4 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 34.5
DDX52Q9Y2R4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 34.3
DDX52Q9Y2R4 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.311e-323■■■■■ 34.3
DDX52Q9Y2R4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 34.3
DDX52Q9Y2R4 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)24.32■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 34.3
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-211ENST00000433098 1197 ntTSL 532.27■■■□□ 2.766e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 528.9■■■□□ 2.226e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 226.89■■□□□ 1.96e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 526.11■■□□□ 1.776e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 325.17■■□□□ 1.626e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 BRAF-202ENST00000469930 1058 ntTSL 224.68■■□□□ 1.546e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.436e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.276e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 ZNF580-204ENST00000590190 335 ntTSL 322.84■■□□□ 1.256e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 322.64■■□□□ 1.216e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.166e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 321.82■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.036e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.026e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.016e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 FAM229A-203ENST00000428500 362 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.17■□□□□ 0.986e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 420.39■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.746e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 419.2■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 GSE1-214ENST00000574293 777 ntTSL 318.52■□□□□ 0.566e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.516e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 218.05■□□□□ 0.486e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 KLHDC4-223ENST00000568499 445 ntTSL 317.61■□□□□ 0.416e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.46e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 416.9■□□□□ 0.36e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.26e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.146e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.076e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 215.24■□□□□ 0.036e-6■■■■■ 34.1
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