Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSUH2Q9Y2M2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSUH2Q9Y2M2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSUH2Q9Y2M2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSUH2Q9Y2M2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSUH2Q9Y2M2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSUH2Q9Y2M2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms