Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMC3Q9UQE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMC3Q9UQE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMC3Q9UQE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SMC3Q9UQE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMC3Q9UQE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms