Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGSF9BQ9UPX0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
IGSF9BQ9UPX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF9BQ9UPX0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IGSF9BQ9UPX0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
IGSF9BQ9UPX0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IGSF9BQ9UPX0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms