Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNRC6BQ9UPQ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNRC6BQ9UPQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNRC6BQ9UPQ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNRC6BQ9UPQ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNRC6BQ9UPQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms