Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FBXO3Q9UK99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FBXO3Q9UK99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FBXO3Q9UK99 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FBXO3Q9UK99 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FBXO3Q9UK99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FBXO3Q9UK99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FBXO3Q9UK99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
FBXO3Q9UK99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FBXO3Q9UK99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FBXO3Q9UK99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
FBXO3Q9UK99 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FBXO3Q9UK99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms