Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA2Q9UJY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA2Q9UJY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA2Q9UJY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA2Q9UJY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GGA2Q9UJY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGA2Q9UJY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA2Q9UJY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms