Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT3LQ9UJW3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3LQ9UJW3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3LQ9UJW3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3LQ9UJW3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3LQ9UJW3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNMT3LQ9UJW3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT3LQ9UJW3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNMT3LQ9UJW3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT3LQ9UJW3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT3LQ9UJW3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNMT3LQ9UJW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms