Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP5Q9UJQ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP5Q9UJQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP5Q9UJQ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP5Q9UJQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP5Q9UJQ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms