Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSRAQ9UJ68 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MSRAQ9UJ68 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MSRAQ9UJ68 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSRAQ9UJ68 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSRAQ9UJ68 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSRAQ9UJ68 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSRAQ9UJ68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms