Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CPA4Q9UI42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CPA4Q9UI42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPA4Q9UI42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPA4Q9UI42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CPA4Q9UI42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CPA4Q9UI42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CPA4Q9UI42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPA4Q9UI42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CPA4Q9UI42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CPA4Q9UI42 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPA4Q9UI42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CPA4Q9UI42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms