Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SS18L2Q9UHA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SS18L2Q9UHA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms