Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNAJB4Q9UDY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAJB4Q9UDY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNAJB4Q9UDY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DNAJB4Q9UDY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNAJB4Q9UDY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms