Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN8Q9UBY8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN8Q9UBY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN8Q9UBY8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms