Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DKK3Q9UBP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DKK3Q9UBP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DKK3Q9UBP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DKK3Q9UBP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DKK3Q9UBP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DKK3Q9UBP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms