Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HDAC6Q9UBN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC6Q9UBN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC6Q9UBN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC6Q9UBN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC6Q9UBN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC6Q9UBN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC6Q9UBN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC6Q9UBN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC6Q9UBN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC6Q9UBN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC6Q9UBN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms