Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1AQ9UBC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1AQ9UBC5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1AQ9UBC5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYO1AQ9UBC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1AQ9UBC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1AQ9UBC5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYO1AQ9UBC5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYO1AQ9UBC5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms