Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNQ9P2M7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNQ9P2M7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CGNQ9P2M7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CGNQ9P2M7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CGNQ9P2M7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms