Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC55.61■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.6■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.6■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.6■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC55.58■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC55.57■■■■■ 6.49
CCDC180Q9P1Z9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.56■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.54■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC55.53■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC55.51■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC55.51■■■■■ 6.48
CCDC180Q9P1Z9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC55.5■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.5■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.49■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC55.48■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.47■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC55.47■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC55.46■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.45■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.44■■■■■ 6.47
CCDC180Q9P1Z9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC55.43■■■■■ 6.46
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
CCDC180Q9P1Z9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.39■■■■■ 6.46
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC55.36■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC55.36■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.34■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC55.34■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC55.31■■■■■ 6.45
CCDC180Q9P1Z9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC55.29■■■■■ 6.44
CCDC180Q9P1Z9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC55.29■■■■■ 6.44
CCDC180Q9P1Z9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC55.28■■■■■ 6.44
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.28■■■■■ 6.44
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC55.25■■■■■ 6.44
CCDC180Q9P1Z9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.24■■■■■ 6.43
CCDC180Q9P1Z9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC55.22■■■■■ 6.43
CCDC180Q9P1Z9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC55.22■■■■■ 6.43
CCDC180Q9P1Z9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.21■■■■■ 6.43
CCDC180Q9P1Z9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.2■■■■■ 6.43
CCDC180Q9P1Z9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC55.17■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC55.17■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.16■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.15■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC55.15■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC55.15■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
CCDC180Q9P1Z9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC55.1■■■■■ 6.41
CCDC180Q9P1Z9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC55.06■■■■■ 6.41
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC55.06■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC55.05■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC55.05■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC55.04■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC55.03■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC55.03■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.01■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC55.01■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.01■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC55■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC55■■■■■ 6.4
CCDC180Q9P1Z9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC54.99■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC54.98■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC54.97■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC54.97■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC54.96■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC54.96■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.95■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC54.94■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
CCDC180Q9P1Z9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
CCDC180Q9P1Z9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
CCDC180Q9P1Z9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC54.9■■■■■ 6.38
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC54.88■■■■■ 6.38
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC54.86■■■■■ 6.37
CCDC180Q9P1Z9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.85■■■■■ 6.37
CCDC180Q9P1Z9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.84■■■■■ 6.37
CCDC180Q9P1Z9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.83■■■■■ 6.37
CCDC180Q9P1Z9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC54.82■■■■■ 6.37
CCDC180Q9P1Z9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC54.81■■■■■ 6.37
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.8■■■■■ 6.36
CCDC180Q9P1Z9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC54.78■■■■■ 6.36
CCDC180Q9P1Z9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC54.77■■■■■ 6.36
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC54.75■■■■■ 6.36
CCDC180Q9P1Z9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC54.75■■■■■ 6.36
CCDC180Q9P1Z9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC54.75■■■■■ 6.36
CCDC180Q9P1Z9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms