Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCN3Q9P1Z3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN3Q9P1Z3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN3Q9P1Z3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCN3Q9P1Z3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCN3Q9P1Z3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms