Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CWC15Q9P013 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC15Q9P013 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC15Q9P013 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CWC15Q9P013 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC15Q9P013 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CWC15Q9P013 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CWC15Q9P013 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC15Q9P013 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC15Q9P013 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC15Q9P013 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC15Q9P013 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC15Q9P013 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC15Q9P013 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CWC15Q9P013 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CWC15Q9P013 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CWC15Q9P013 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CWC15Q9P013 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CWC15Q9P013 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC15Q9P013 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CWC15Q9P013 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC15Q9P013 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC15Q9P013 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CWC15Q9P013 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms