Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MIS18AQ9NYP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MIS18AQ9NYP9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MIS18AQ9NYP9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MIS18AQ9NYP9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MIS18AQ9NYP9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MIS18AQ9NYP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MIS18AQ9NYP9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MIS18AQ9NYP9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MIS18AQ9NYP9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms