Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDE1Q9NXR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDE1Q9NXR1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDE1Q9NXR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDE1Q9NXR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDE1Q9NXR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDE1Q9NXR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDE1Q9NXR1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms