Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
DNAJC28Q9NX36 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNAJC28Q9NX36 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAJC28Q9NX36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNAJC28Q9NX36 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAJC28Q9NX36 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.6 ms