Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLN6Q9NWW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLN6Q9NWW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLN6Q9NWW5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLN6Q9NWW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms