Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TBCCD1Q9NVR7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TBCCD1Q9NVR7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBCCD1Q9NVR7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBCCD1Q9NVR7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms