Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD2Q9NV79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD2Q9NV79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD2Q9NV79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCMTD2Q9NV79 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCMTD2Q9NV79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCMTD2Q9NV79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms