Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00846Q9NV44 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00846Q9NV44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00846Q9NV44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00846Q9NV44 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms